Со времен событий Teegane Mutant Ninja Turtles (v2) прошло много лет, но некоторые вещи просто не хотят меняться. Черепахи оказываются на территории группировки Madhattan Maulitia и вынуждены прорываться с боем. По пути они теряют Микеланджело и Донателло.
Сбитый автобусом, Микеланджело приходит в себя в госпитале для супергероев, где встречается со старыми знакомыми.
В Нью-Йорк и другие города опускаются множество огромных цилиндрических объектов - на Землю высаживаются пришельцы. И судя по всему, они не собираются так скоро улетать.
Америка - а может, и весь мир - застыла в ожидании у экранов телевизоров. Но вот, пришельцы появились - это утромы. Раф и Майк прогуливаются по канализации и на них нападает здоровенный робот...
Коробон в прямом эфире объясняет причину, по которой утромы открыто прибыли на Землю.
Ханикат и утромы проводят обследование Эйприл и выясняют, что в ее теле находятся несколько тысяч наноботов, которыми ее инфицировал Бакстер Стокман.
Наноботы начинают прогрессировать, и Эйприл впадает в кому. Ей нужна трансплантация тканей. Для этого Кейси вызывает на базу ее сестру Робин.
Мистер Бронзи приезжает в дом Сплинтера, чтобы разрешить ситуацию с Джеем. Доктор берет анализ ДНК из останков родителей Эйприл и Робин и сообщает очередную шокирующую новость...
Пытаясь спасти Эйприл, Донателло просит помощи у виновника всех ее бед.
Наночерепахоботы Донателло вступают в бой за жизнь Эйприл.
Черепахи и их друзья собираются, чтобы отдать последние почести учителю Сплинтеру.
Эйприл впадает в депрессию и разбирает старые вещи, Донателло принимает приглашение утромов отправиться в джунгли, а Рафаэль шляется по барам.
Микеланджело устраивается в межпланетное туристическое агентство, созданное утромами.
Донни и утромы попадают в ловушку, Майки устраивает экскурсию для Сери, Регенты (принцессы) Стиракодонов, а Лео снова встречается с Караи. Эйприл вызывает Ренет и просить помочь узнать ее прошлое. И теперь ее жизнь никогда не будет прежней.
Мутировавший Раф вырывается на свободу.
Леонардо сражается с таинственным воином, терроризирующим "Фут". Донателло с собратьями по несчастью продолжают исследовать свою странную тюрьму.
Караи и Лео допрашивают воина, напавшего на "Фут", а Раф и Лезерхед делят территорию.
Рафаэль возвращается в логово, и его посещают видения об учителе Сплинтере. Тюремщики Донателло показывают свое истинное лицо.
-----
-----
-----
Впервые за 21 год - выпуск без черепах!
Эйприл рассказывает Кейси о своем прошлом. О том, кто она, и как появилась на свет.
-----
-----
Леонардо использует ритуал из книг Сплинтера, чтобы открыть портал на Battle Nexus.
Микеланджело удается сбежать из города стиракодонов, но, бродя в поисказх еды, он попадает в лапы... к трицератонам?
Узнав, что Азокк погиб, трицератоны сворачивают лагерь и покидают планету вместе с Майки. Дон, Раптарр и Рафаэль находят изобретателя "Гардифренда", который напал на Шэдоу.
Майки обустраивается на звездном корабле трицератонов и его знакомят с руководителем специальной армии, вытренерованной по образу и подобию черепах. Кроме того, сам руководитель лишился правого глаза во время бегства черепах с Три-Спортс Арены более пятнадцати лет назад.
Кейси, Фуджитоид и их друзья-утромы находят неприятности в пивной, Леонардо заводит новых друзей и потенциальных врагов на Battle Nexus, а Майки узнает все больше о своих спутниках-трицератонах.
Кейси просыпается в постели Караи, а затем отправляется поплавать в бассейне с акулой! Тем временем Майки предстает перед Верховным Судом трицератонов, который должен решить его дальнейшую судьбу.
Трицератоны начинают полномасштабную войну против стиракодонов, а Леонардо ждет очередной сюрприз.